研究生學(xué)院現(xiàn)設(shè)有教學(xué)培養(yǎng)科、學(xué)科建設(shè)科、學(xué)生管理科、中心實驗室、綜合辦公室四個科室，黨總支書記和院長各1名、副主任1名、教學(xué)和學(xué)生管理、中心實驗室管理人員等工作人員9名，教授3人，副教授3人，中級職稱4人。
研究生部自2002年成立以來，通過不斷加強(qiáng)學(xué)科和導(dǎo)師隊伍的建設(shè)，進(jìn)一步改善辦學(xué)條件與科學(xué)研究環(huán)境，使我校的研究生教育工作有了長足的進(jìn)步。自2000年開始至今，我校二級碩士學(xué)位授予權(quán)學(xué)科已由1個增至12個，2010年又新增生物學(xué)醫(yī).學(xué)全.在.線網(wǎng)站jfsoft.net.cn、臨床醫(yī)學(xué)和公共衛(wèi)生與預(yù)防醫(yī)學(xué)三個一級碩士學(xué)位授予權(quán)學(xué)科，新增臨床醫(yī)學(xué)碩士和公共衛(wèi)生碩士兩種專業(yè)學(xué)位，現(xiàn)有碩士生導(dǎo)師170多人，目前在校研究生370人。2006年獲得同等學(xué)力人員申請碩士學(xué)位授予權(quán)，并開辦了六期研究生課程進(jìn)修班。
自2005年學(xué)院將學(xué)科建設(shè)工作由研究生學(xué)院管理以來，我們積極開展學(xué)位點與學(xué)科建設(shè)各項工作，取得了良好的成效。2005年確定了19個院級重點學(xué)科、22個院級重點建設(shè)學(xué)科。2008年積極組織各院系申報自治區(qū)重點學(xué)科，經(jīng)內(nèi)蒙古自治區(qū)教育廳審核批準(zhǔn)，我院新增3個學(xué)科自治區(qū)重點學(xué)科，2個自治區(qū)重點培育學(xué)科。我院現(xiàn)有自治區(qū)教育系統(tǒng)重點學(xué)科4個：生物化學(xué)與分子生物學(xué)、人體解剖與組織胚胎學(xué)、內(nèi)科學(xué)（心血管病)、內(nèi)科學(xué)（風(fēng)濕病)；自治區(qū)教育系統(tǒng)重點培育學(xué)科2個：生理學(xué)、藥理學(xué)；2009年自治區(qū)衛(wèi)生廳重新確定和評審領(lǐng)先學(xué)科、重點學(xué)科及重點實驗室，我校的腎內(nèi)科、消化內(nèi)科被確定為領(lǐng)先學(xué)科；神經(jīng)外科學(xué)、風(fēng)濕與自體免疫病學(xué)、急診急救醫(yī)學(xué)被評為重點學(xué)科；醫(yī)學(xué)分子生物學(xué)實驗室、人體解剖學(xué)實驗室、營養(yǎng)與食品衛(wèi)生學(xué)實驗室被評為重點實驗室。
