南京醫(yī)科大學藥學院創(chuàng)建于2002年6月。藥學院由藥理學系（省重點學科，全國臨床藥理基地、江蘇省產(chǎn)學研研究生聯(lián)合培養(yǎng)基地）和毒理學系（省重點學科）發(fā)起，從國內(nèi)外引進藥物化學、藥劑學、藥物分析學、生化藥學、生物技術(shù)、天然藥物學等學科的高層次人才，整合原基礎(chǔ)醫(yī)學院化學教研室并聯(lián)合江蘇省人民醫(yī)院藥劑科，經(jīng)過4年的南京醫(yī)科大學藥學院創(chuàng)建于2002年6月。藥學院由
藥理學系（省重點學科，全國臨床藥理基地、江蘇省產(chǎn)學研研究生聯(lián)合培養(yǎng)基地)和毒理學系（省重點學科)發(fā)起，從國內(nèi)外引進藥物化學、藥劑學、藥物分析學、生
化藥學、生物技術(shù)、天然藥物學等學科的高層次人才，整合原基礎(chǔ)醫(yī)學院化學教研室并聯(lián)合江蘇省人民醫(yī)院藥劑科，經(jīng)過4年的建設(shè)，藥學院已初步建成教研相長的教學研究型學院框架，初步建立生物醫(yī)學型的藥學教育模式，堅持面向臨床，服務(wù)經(jīng)濟建設(shè)的辦學宗旨。
學院起初設(shè)有臨床藥學、基礎(chǔ)藥學、藥學、藥政管理、醫(yī)藥貿(mào)易五個藥學專業(yè)方向，2005年起改設(shè)臨床藥學和藥學兩個專業(yè)方向，近幾年招收各類本科生559人。學院于2005年獲得國家藥學一級學科碩士學位授予權(quán)。藥理學為博士學位授予點。已招收博士、碩士生30名。
學院現(xiàn)有教職員工51人，其中教師35人，實驗室技術(shù)人員9人，專職行政管理人員7人。教師中正副教授（相當職稱)10人，博導1人、碩導7人，具有博士學位者8 人，碩士學位者 21人，碩士生以上學歷教師占80%，另有兼職正副教授12人。
學院現(xiàn)有9個教研室，分別為基礎(chǔ)化學、有機化學、分析化學、物理化學、藥劑學、藥物化學、藥物分析、藥理學（臨床藥理)、天然藥物教研室。2004年9月，省級重點實驗室——江蘇省基因藥物技術(shù)中心在藥學院成立。學院應(yīng)用藥物研究所和藥物分析測試中心于2005、2006年分別成立。學院化學與藥學綜合教學實驗室建設(shè)在江寧新校區(qū)。 醫(yī)學
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www.med126.com 學院在江寧校區(qū)已建成8個高標準的化學教學實驗室和1個化學科研實驗室、2個天平室和1個教學電腦室。建筑面積近2000M2。在五臺校區(qū)，建成6個藥學科研實驗室和1個化學科研實驗室，建筑面積600多M2。已投資的儀器設(shè)備費和基本設(shè)施費約500萬元，配備有高效液相色譜、氣相色譜、紫外掃描儀、紅外分光光度計等大型教學儀器。
建院四年來，學院共承擔縱向科研項目13項，其中國家自然科學基金項目2項，省級項目11項，獲科研經(jīng)費150萬元，發(fā)表論文63篇，其中被SCI收錄論文18篇。同時，全院教職員工以自己的知識積極為社會服務(wù)，科技服務(wù)開發(fā)也取得一定成績，科技開發(fā)經(jīng)費已累計500多萬元。
學院在近三年發(fā)展的總體目標是：逐步突出臨床藥學品牌，穩(wěn)定招生規(guī)模，促進科學研究和科技開發(fā)，繼續(xù)引進藥學高端人才，為學院在“十一五”的跨越式發(fā)展奠定堅實的基礎(chǔ)。
