基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院是南京中醫(yī)藥大學(xué)最大的一個教學(xué)科研機構(gòu)，由中醫(yī)基礎(chǔ)學(xué)科、現(xiàn)代醫(yī)學(xué)基礎(chǔ)學(xué)科及部分公共基礎(chǔ)學(xué)科組成。全院共設(shè)10個教學(xué)科研單位，其中包括正常人體形態(tài)與功能學(xué)系(正常人體解剖與組織胚胎學(xué)教研室、生理學(xué)教研室)、人體疾病學(xué)與預(yù)防醫(yī)學(xué)系（病理學(xué)教研室、病原與免疫學(xué)教研室、醫(yī)學(xué)統(tǒng)計與預(yù)防醫(yī)學(xué)教研室）、生物基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院是
南京中醫(yī)藥大學(xué)最大的一個教學(xué)科研機構(gòu)，由中醫(yī)基礎(chǔ)學(xué)科、現(xiàn)代醫(yī)學(xué)基礎(chǔ)學(xué)科及部分公共基礎(chǔ)學(xué)科組成。全院共設(shè)10個教學(xué)科研單位，其中包括正常人體形態(tài)與功能學(xué)系(正常人體解剖與組織胚胎學(xué)教研室、生理學(xué)教研室)、人體疾病學(xué)與預(yù)防醫(yī)學(xué)系（病理學(xué)教研室、病原與免疫學(xué)教研室、醫(yī)學(xué)統(tǒng)計與預(yù)防醫(yī)學(xué)教研室)、生物與生化學(xué)系（生物學(xué)教研室、生物化學(xué)教研室)、中醫(yī)基礎(chǔ)學(xué)系（中醫(yī)基礎(chǔ)理論與內(nèi)經(jīng)教研室、中醫(yī)診斷學(xué)教研室)、中醫(yī)方藥學(xué)系（中藥學(xué)教研室、方劑學(xué)教研室)、中醫(yī)臨床基礎(chǔ)學(xué)系（溫病學(xué)教研室、
傷寒與金匱要略教研室)、中醫(yī)醫(yī)史文獻學(xué)系（醫(yī)古文教研室、中醫(yī)醫(yī)學(xué)史與各家學(xué)說教研室)、數(shù)理學(xué)系（數(shù)學(xué)教研室、物理教研室)8個學(xué)系（17個教研室)，1個教學(xué)實驗中心和1個中醫(yī)藥文獻研究所。另外，還設(shè)有醫(yī)史博物館和南京中醫(yī)藥大學(xué)門診部。
醫(yī)學(xué)全.在.線網(wǎng)站jfsoft.net.cn 學(xué)院目前在職教職員工139人，其中教授21人，副教授36人；正研究員4人，副研究員5人，副主任醫(yī)師1人；博士生導(dǎo)師15人，碩士生導(dǎo)師32人；享受國務(wù)院特殊津貼者有3人，江蘇省名中醫(yī)專家4人，國家教學(xué)名師1人。在一大批建樹頗豐的中醫(yī)名家的帶領(lǐng)下，一批中青年骨干教師也正在茁壯成長，有的已經(jīng)在學(xué)術(shù)界嶄露頭角，脫穎而出，其中有省級中青年專家1人，省“青藍工程”1人，省“333工程”第二層次培養(yǎng)對象1人，中青年教師具有博士學(xué)位的27人、碩士學(xué)位的53人，占全院教師總數(shù)的70.18%。
基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院是“國家理科科學(xué)研究和人才培養(yǎng)基地”（試辦)，擁有國家教育部重點學(xué)科1個——中醫(yī)醫(yī)史文獻學(xué)科；國家中醫(yī)藥管理局局級重點學(xué)科建設(shè)單位3個——中醫(yī)醫(yī)史文獻學(xué)科、中醫(yī)臨床基礎(chǔ)學(xué)科、方劑學(xué)學(xué)科；江蘇省政府重點學(xué)科1個——中醫(yī)臨床基礎(chǔ)學(xué)科。教學(xué)實驗中心為江蘇省高等學(xué)�；A(chǔ)課實驗教學(xué)示范中心建設(shè)點（中西醫(yī)基礎(chǔ)教學(xué)實驗中心)。有博士點、碩士點各7個—中醫(yī)基礎(chǔ)理論、中醫(yī)醫(yī)診斷學(xué)、方劑學(xué)、中藥學(xué)、中醫(yī)臨床基礎(chǔ)學(xué)科、中醫(yī)醫(yī)史文獻、中西醫(yī)結(jié)合基礎(chǔ)；碩、博士點涵蓋了學(xué)院所有的中醫(yī)基礎(chǔ)學(xué)科和現(xiàn)代醫(yī)學(xué)基礎(chǔ)學(xué)科。在課程與教材建設(shè)方面，學(xué)院有國家精品課程1門，江蘇省一類優(yōu)秀課程2門，二類優(yōu)秀課程5門；國家推選研究生使用教材1門，主編《中醫(yī)基礎(chǔ)理論》、《方劑學(xué)》、《溫病學(xué)》、《病理學(xué)》等中醫(yī)院校統(tǒng)編教材、規(guī)劃教材。學(xué)院主辦江蘇省品牌專業(yè)——中醫(yī)學(xué)專業(yè),包括中醫(yī)學(xué)（中西醫(yī)結(jié)合)、中醫(yī)學(xué)（臨床醫(yī)學(xué))、中醫(yī)學(xué)（國家理科基地班)、中醫(yī)學(xué)（醫(yī)學(xué)生物技術(shù))等12個專業(yè)方向，目前在院本科生2050人，博、碩士生220人。
學(xué)院在精心組織教學(xué)的同時，以重點學(xué)科為龍頭，結(jié)合各自的專業(yè)，充分發(fā)揮自身的特點和優(yōu)勢，積極組織廣大教師申報各級各類的有關(guān)科研課題，潛心進行科學(xué)研究。目前在研科研課題53項，其中，國家科技部重大基礎(chǔ)研究前期課題1項，國家自然科學(xué)基金課題4項，單項經(jīng)費達到50萬元。繼《中醫(yī)方劑大辭典》、《中華本草》出版后，又一部跨世紀(jì)大型中醫(yī)藥學(xué)著作——新世紀(jì)版《中藥大辭典》已正式開編。
2002年以來學(xué)院曾先后獲得南京中醫(yī)藥大學(xué)精神文明單位、學(xué)院黨總支獲得江蘇省先進基層黨組織、院分工會獲得江蘇省總工會優(yōu)秀職工之家等稱號。
在“十一五”規(guī)劃期間，基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院全體師生，正以高度的歷史責(zé)任感和緊迫感，以飽滿的工作熱情，奮力拼搏，開拓創(chuàng)新，為使學(xué)院各項工作更上一個新臺階而努力奮斗。
