東南大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院位于風(fēng)景秀麗的玄武湖畔，環(huán)境優(yōu)美的丁家橋校區(qū)。學(xué)院設(shè)有病原生物學(xué)與免疫學(xué)、遺傳學(xué)與發(fā)育生物學(xué)、病理學(xué)與病理生理學(xué)、人體解剖學(xué)與組織胚胎學(xué)、生理學(xué)與藥理學(xué)五個(gè)學(xué)系，擁有一個(gè)研究中心、四個(gè)醫(yī)學(xué)科學(xué)研究所，一個(gè)計(jì)算機(jī)中心和一個(gè)實(shí)驗(yàn)中心�！ W(xué)院擁有一個(gè)省級重點(diǎn)學(xué)科（遺傳學(xué)）；兩個(gè)省部級重東南大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院位于風(fēng)景秀麗的玄武湖畔，環(huán)境優(yōu)美的丁家橋校區(qū)。學(xué)院設(shè)有病原生物學(xué)與免疫學(xué)、遺傳學(xué)與發(fā)育生物學(xué)、病理學(xué)與
病理生理學(xué)、人體解剖學(xué)與組織胚胎學(xué)、生理學(xué)與
藥理學(xué)五個(gè)學(xué)系，擁有一個(gè)研究中心、四個(gè)醫(yī)學(xué)科學(xué)研究所，一個(gè)計(jì)算機(jī)中心和一個(gè)實(shí)驗(yàn)中心。
學(xué)院擁有一個(gè)省級重點(diǎn)學(xué)科（遺傳學(xué))；兩個(gè)省部級重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室（江蘇省“135工程”基因診斷與基因治療重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、教育部“發(fā)育與疾病相關(guān)基因”重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室)和國際“HLA表達(dá)與
腫瘤“參考實(shí)驗(yàn)室�，F(xiàn)有博士點(diǎn)1個(gè)，碩士點(diǎn)10個(gè)。遺傳學(xué)為醫(yī)學(xué)院首批博士學(xué)位授權(quán)點(diǎn)，"長江學(xué)者獎(jiǎng)勵(lì)計(jì)劃"特聘教授設(shè)崗單位。遺傳學(xué)、生物化學(xué)、病理學(xué)、生理學(xué)、病原微生物學(xué)、免疫學(xué)、人體解剖學(xué)與組織胚胎學(xué)均為國務(wù)院首批批準(zhǔn)的碩士學(xué)位授權(quán)點(diǎn)，2003年新增發(fā)育生物學(xué)、藥理學(xué)、生物工程學(xué)碩士學(xué)位授權(quán)點(diǎn)。培養(yǎng)了一批優(yōu)秀的畢業(yè)研究生，其中，楊煥明、賀林等在生命科學(xué)領(lǐng)域都已成為國內(nèi)外學(xué)術(shù)界知名科學(xué)家。
學(xué)院在腫瘤發(fā)生的免疫遺傳學(xué)；腫瘤發(fā)生的表遺傳學(xué)機(jī)制；疾病的基因診斷與基因治療；基因工程藥物、疫苗的研究；基因組與生物信息學(xué)；神經(jīng)內(nèi)分泌生理；呼吸生理基因表達(dá)與調(diào)控；臨床生化發(fā)育相關(guān)基因的功能研究；粘細(xì)菌發(fā)育的分子機(jī)制；干細(xì)胞的基礎(chǔ)與應(yīng)用；腦移植與中樞神經(jīng)系統(tǒng)再生與修復(fù)；腦血管病性
腦損傷與修復(fù)機(jī)制；中樞神經(jīng)系統(tǒng)發(fā)育、再生與免疫調(diào)控；基因工程抗原抗體；免疫調(diào)節(jié)；基因免疫；病毒感染和病毒免疫；細(xì)菌毒素；分
子腫瘤學(xué)；肝臟病理；腎臟病理；神經(jīng)免疫藥理；心血管免疫藥理等生命科學(xué)和基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)領(lǐng)域開展多方位研究。2000年至今，學(xué)院獲得“杰出青年基金”項(xiàng)目1項(xiàng)，“973”、“863”計(jì)劃子課題3項(xiàng)，國家自然科學(xué)基金18項(xiàng)，美國NIH課題1項(xiàng)，省部級項(xiàng)目60余項(xiàng)。學(xué)院積極開展國內(nèi)外學(xué)術(shù)交流，先后與美國、加拿大、丹麥、挪威、德國、法國等國家10余所醫(yī)學(xué)院校、科研機(jī)構(gòu)建立了學(xué)術(shù)交流及合作科研關(guān)系，聘請國內(nèi)外著名專家11人為兼職教授，其中院士3人。
學(xué)院具有一支以學(xué)術(shù)造詣較深的專家、教授為龍頭，中青年骨干教師為主體，結(jié)構(gòu)合理的教學(xué)科研隊(duì)伍。有多名從國外歸來的博士后學(xué)科帶頭人和一批有博士學(xué)位的中青年骨干教師。有“長江學(xué)者獎(jiǎng)勵(lì)計(jì)劃”特聘教授1名；教育部優(yōu)秀教師1名；國家杰出青年基金獲得者1名；8江蘇省"333"工程和"青藍(lán)工程"學(xué)術(shù)帶頭人、江蘇省"青藍(lán)工程"優(yōu)秀骨干教師多名；國家、省部級“有突出貢獻(xiàn)”的中青年專家多名。
學(xué)院設(shè)有生物工程（四年制本科)專業(yè)，培養(yǎng)掌握較為扎實(shí)的現(xiàn)代生命科學(xué)基礎(chǔ)理論和實(shí)驗(yàn)技術(shù)，具有良好的工程學(xué)基礎(chǔ)，全面發(fā)展的復(fù)合型、應(yīng)用型、研究型，能在理、工、農(nóng)、醫(yī)、藥等生物工程相關(guān)領(lǐng)域從事教育、科技和管理工作的高級專門人才，為國家的經(jīng)濟(jì)建設(shè)服務(wù)。本專業(yè)有博士、碩士學(xué)位授予權(quán)，優(yōu)秀本科生可免試推薦攻讀碩士、博士，進(jìn)行一體化培養(yǎng)。
目前，學(xué)院已形成了從本科生、碩士生、博士生、博士后到留學(xué)生一整套人才培養(yǎng)體系，承擔(dān)5年制與7年制醫(yī)學(xué)和生命科學(xué)各專業(yè)各層次40多門基礎(chǔ)課程的教學(xué)任務(wù)，年教學(xué)工作量近3萬課時(shí)。
