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對鮑氏志賀氏菌11型和大腸桿菌0105的O-抗原特異的核苷酸

公開(公告)號 CN1274824C  
公開(公告)日 2006.09.13  
申請(專利)號 CN03100535.7  
申請日期 2003.01.20  
專利名稱 對鮑氏志賀氏菌11型和大腸桿菌0105的O-抗原特異的核苷酸  
主分類號 C12N15/11(2006.01)I  
分類號 C12N15/11(2006.01)I;C12N15/09(2006.01)I;C12N15/00(2006.01)I;C07H21/00(2006.01)I;C12N15/31(2006.01)I;C12Q1/68(2006.01)I;G01N33/569(2006.01)I  
分案原申請?zhí)?  
優(yōu)先權  
申請(專利權)人 南開大學  
發(fā)明(設計)人 王 磊;陶 江;馮 露  
地址 300071天津市南開大學生命科學學院  
頒證日  
國際申請  
進入國家日期  
專利代理機構 天津三元專利商標代理有限責任公司  
代理人 胡婉明  
國省代碼 天津;12  
主權項 一種對鮑氏志賀氏菌11型和大腸桿菌O105的O-抗原特異的寡核苷酸對,其特征在于,其寡核苷酸對是:SEQIDNO:1中的4882至4900堿基的核苷酸和5283至5300堿基的核苷酸;SEQIDNO:1中的5116至5133堿基的核苷酸和5386至5403堿基的核苷酸;SEQIDNO:1中的4681至4697堿基的核苷酸和5373至5390堿基的核苷酸;SEQIDNO:1中的5620至5638堿基的核苷酸和5980至5998堿基的核苷酸;SEQIDNO:1中的5517至5536堿基的核苷酸和6323至6341堿基的核苷酸;SEQIDNO:1中的5439至5457堿基的核苷酸和5831至5847堿基的核苷酸;SEQIDNO:1中的6578至6596堿基的核苷酸和7014至7032堿基的核苷酸;SEQIDNO:1中的6664至6682堿基的核苷酸和6882至6899堿基的核苷酸;SEQIDNO:1中的6717至6735堿基的核苷酸和6977至6995堿基的核苷酸;SEQIDNO:1中的7502至7520堿基的核苷酸和7974至7992堿基的核苷酸;SEQIDNO:1中的8019至8036堿基的核苷酸和8372至8391堿基的核苷酸;SEQIDNO:1中的7376至7394堿基的核苷酸和8219至8237堿基的核苷酸;SEQIDNO:1中的8674至8691堿基的核苷酸和9200至9218堿基的核苷酸;SEQIDNO:1中的8814至8832堿基的核苷酸和9139至9157堿基的核苷酸;SEQIDNO:1中的8543至8560堿基的核苷酸和9053至9070堿基的核苷酸;SEQIDNO:1中的9727至9745堿基的核苷酸和10308至10325堿基的核苷酸;SEQIDNO:1中的9784至9802堿基的核苷酸和10015至10033堿基的核苷酸;SEQIDNO:1中的9430至9457堿基的核苷酸和10220至10239堿基的核苷酸;SEQIDNO:1中的10484至10502堿基的核苷酸和10748至10765堿基的核苷酸;SEQIDNO:1中的10599至10617堿基的核苷酸和11509至11527堿基的核苷酸;SEQIDNO:1中的10997至11015堿基的核苷酸和11692至11710堿基的核苷酸。  
摘要 本發(fā)明提供一種對鮑氏志賀氏菌11型和大腸桿菌0105的O-抗原特異的核苷酸,它是鮑氏志賀氏菌11型(Shigella boydii 11)中控制O-抗原合成的基因簇的核苷酸全序列。還包括O-抗原基因簇的結構以及源于鮑氏志賀氏菌11型的O-抗原基因簇中的糖基轉移酶基因和寡糖單位處理基因(包括wzx基因或與wzx有相似功能的基因、wzy基因或與wzy有相似功能的基因)的寡核苷酸,并且包括獲得細菌O-抗原基因簇的方法。本發(fā)明通過PCR證實它們對鮑氏志賀氏菌11型和大腸桿菌0105的O-抗原都有高度的特異性。本發(fā)明還公開了用本發(fā)明的寡核苷酸檢測和鑒定人體及環(huán)境中的鮑氏志賀氏菌11型和大腸桿菌0105的方法。  
國際公布  
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