MHC I類(lèi)、Ⅱ類(lèi)基因外顯子和內(nèi)含子的組成相似（圖6-11)。第一個(gè)外顯子編碼先導(dǎo)序列。MHc I類(lèi)分子α1、α2和α3是由三個(gè)不同的外顯子所編碼，空膜區(qū)和胞漿區(qū)是由數(shù)個(gè)較小的外顯子編碼。MHc I類(lèi)分子胞漿部分每一個(gè)保守的磷酸化位點(diǎn)是由不同的小外顯子分別編碼。有多個(gè)調(diào)節(jié)MHC基因的轉(zhuǎn)錄的順式調(diào)節(jié)順序（cis-regulatory sequences)位于MHC基因外顯子的5`端，這些調(diào)節(jié)順序是作為反式作用的轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)蛋白的結(jié)合位點(diǎn)。此外，在MHc I類(lèi)基因中也發(fā)現(xiàn)有啟動(dòng)子和增強(qiáng)子，并存在著對(duì)細(xì)胞因子特別是IFN-γ應(yīng)答的核苷酸序列。在MHc Ⅱ類(lèi)基因中含有對(duì)于Ⅱ類(lèi)基因表達(dá)所必需的、稱(chēng)之為W（或H)、X和Y盒的三個(gè)保守的核甘酸序列。
圖6-11 MHc Ⅰ、Ⅱ類(lèi)基因外顯子內(nèi)含子結(jié)構(gòu)
IFN-γ可調(diào)節(jié)MHC I類(lèi)和Ⅱ類(lèi)分子的表達(dá)。IFN-γ幾乎對(duì)所有細(xì)胞MHc I類(lèi)抗原的表達(dá)有促進(jìn)作用，其他的細(xì)胞因子如IFN-α、INF-β、TNF和LT也能促進(jìn)MHc I類(lèi)分子的表達(dá)。IFN-γ等細(xì)胞因子促進(jìn)I類(lèi)分子表達(dá)水平升高的機(jī)理可能是細(xì)胞因子激活的轉(zhuǎn)錄因子（cytokine-activated transcription factors)結(jié)合到I類(lèi)基因DNA的調(diào)節(jié)序列上。IFN-γ可促進(jìn)單核-巨噬細(xì)胞、郎罕氏細(xì)胞NHc Ⅱ類(lèi)分子的表達(dá)，誘導(dǎo)MHc Ⅱ類(lèi)分子陰性的內(nèi)皮細(xì)胞、上皮細(xì)胞和基質(zhì)細(xì)胞（stromal cell)表達(dá)Ⅱ類(lèi)分子；樹(shù)突狀細(xì)胞和活化人T細(xì)胞可表達(dá)Ⅱ類(lèi)分子，但I(xiàn)FN-γ無(wú)明顯調(diào)節(jié)作用；對(duì)于小鼠B細(xì)胞，IFN-γ作用后Ⅱ類(lèi)分子表達(dá)反而降低，而IL-4有促進(jìn)表達(dá)的作用。
